为什么病毒难治愈？
要理解病毒的结构。 病毒没有细胞结构，它必须依赖于宿主细胞的能量系统存活并繁殖。为了达到这个目的，它们需要入侵宿主细胞，并在其中进行大量的复制。从病毒开始侵入细胞到完全增殖，这个过程通常很短，只有几个小时，甚至更短。由于病毒基因组简单，所以它在短短的几个小时内就可以大量复制自身，从而产生成千上万的子代病毒颗粒。虽然病毒可以通过自身的蛋白质外壳吸收并传递所需要的营养物质，但最重要的是它需要依赖细胞内的物质来合成病毒的蛋白酶和核酸聚合酶，以及建立病毒的基因表达装置。 一旦病毒侵入细胞，它会立即开始循环合成这些病毒蛋白，然后组装成新的病毒颗粒。
其次，了解病毒的治愈过程。 在病毒感染的早期，免疫系统会识别病毒粒子并将其视为外来物加以清除。然而，对于某些病毒特别是那些RNA病毒，免疫系统的反应往往有限且不够迅速。这时，如果药物能阻断病毒进入细胞的途径，或抑制病毒蛋白的表达，就有可能控制病毒的复制，最后使病毒被逐渐消除。抗病毒治疗主要是通过药物的作用来干扰病毒生命周期中的某一阶段，进而达到消灭病毒的目的。
然而，大多数病毒是难以被彻底杀灭的，因为它们能够编码多种抗药因子，并且能够通过突变来适应药物的压力。同时，许多病毒可能仅存在少量寄生在细胞中，并且很难被药物完全杀灭，这样就会导致病毒株具有抗药性，给今后的药物治疗带来困难。
第三，从病毒的特性方面进行分析。 与细菌相比，病毒是没有细胞结构的，所以不能进行分裂而只能进行增殖。无论使用哪种药物，病毒的数量都是有限的。而且，有些药物只对病毒的某一种变异型有效，而病毒在不断进化，不同的病毒感染机体后所产生的病理反应也不一样，这就使得在治疗过程中存在着不确定性因素，治疗的难度大大增加。尽管目前有许多药物可以用于预防及治疗病毒性疾病，但是病毒自身的特性决定了这些药物的局限性。